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考博生化和分子生物学复习笔记-第7章

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代谢受抑制。
▲转录过程分为三个阶段:起始、延长及终止。 1。起始 RNA聚合酶的σ因子识别DNA启动子的识别部位,RNA聚合酶核心酶则结合在启动子的结合部位。在与RNA聚合核心酶结合的Pribonow盒附近,双链暂时打开约17个碱基对长度,展 示出DNA模板链,有利于RNA聚合酶进入转录泡,催化RNA聚合作用。 转录作用开始时,根据DNA模板链上的核苷酸的序列,NTP根据碱基互补原则依次进入反应 体系。在RNA聚合酶的催化下,起始点处相邻的前两个NTP以3′、5′一磷酸二酯键相连接。随后,σ因子从模板及RNA聚合酶上脱落下来,于是RNA聚合酶的核心酶沿着模板向下游移 动,转录作用进入延长阶段。脱落下的σ因子可以再次与核心酶结合而循环使用。 2。延长 在RNA聚合酶的催化下,核苷酸之间以3′、5′一磷酸二酯键相连接进行着RNA的合成反应,合成方向为5′→3′。在延长过程中,局部打开的DNA双链、RNA聚合酶及新生成转录本RNA局部形成转录泡。随RNA聚合酶的移动,转录泡也行进,贯穿于延长始终。 3。终止 在RNA延长进程中,当RNA聚合酶行进到DNA模板的终止信号时,RNA聚合酶就不再继续前进,聚合作用也因此停止。由于终止信号中有由GC富集区组成的反向重复序列,在 转录生成的mRNA中有相应的发卡结构。此发卡结构可阻碍RNA聚合酶的行进,由此而停 止了RNA聚合作用。在终止信号中还有AT富集区,其转录生成的mRNA3′末端有多个U残 基。
 二、转录后的加工过程 转录作用产生出的mRNA、tRNA及rRNA的初级转录本全是前体RNA,而不是成熟的RNA ,没有生物学活性,还要在酶的作用下,进行加工才能变为成熟的有活性的RNA。 RNA的加工过程主要是在细胞核内进行,也有少数反应是在胞质中进行。 RNA加工的类型有:  剪切及剪接:剪切就是剪去部分序列;剪接是指剪切后又将某些片段连接起来。 末端添加核苷酸:例如tRNA的3′…末端添加…CCA。 修饰:在碱基及核糖分子进行化学修饰。 RNA编辑:某些RNA,特别是mRNA自DNA模板上所获得的遗传信息,在转录作用后又发生了变化。 
(一)mRNA前体的加工 1。mRNA生成的特点 (1)原核生物mRNA的生成。多顺反子。即几个结构基因,利用共同的启动子及共同的终止信号,经转录作用生成mRNA分子,所以此mRNA分子可编码几种不同的蛋白质。 原核生物中,细胞内没有核膜,染色质存在于胞质中,所以转录与翻译进行的场所没有明显的屏障。在转录尚未完成时,翻译就已开始了。而且,mRNA的寿命十分短暂。 (2)真核生物mRNA生成。单顺反子,一个mRNA分子只编码一种蛋白质。 真核生物的结构基因中包含有具有表达活性的编码蛋白质序列,称为外显子;还含有无表达 活性的序列,称为内含子。由于内含于是插在外显子之间,所以又称为插入序列。转录生成 的mRNA前体中有外显子部分的,也有内含子部分的。在加工时,前体要进行剪接 作用。 2。mRNA前体的加工 原核生物转录生成的初级转录本mRNA不需经过复杂的加工就表现有活性。唯一的加工作用是多顺反子mRNA在RNaseⅢ的催化下,裂解为单独的顺反子。 真核生物转录生成的mRNA要经过较复杂的加工过程。包括①5′末端加帽②3′端加尾③剪接 去除内含子并连接外显子④核苷酸编辑⑤甲基化修饰。 (1)5′末端帽子的生成。步骤 ①mRNA5′末端pppNp在磷酸酶作用下脱Pi,形成ppNp…。②在鸟苷酸转移酶作用下,与 Gppp反应形成GpppNp…。③在甲基转移酶作用下,由腺苷蛋氨酸(SAM)提供甲基,在鸟 嘌呤的N…7上甲基化,然后在连接于鸟苷酸的第一个(或第二个)核苷酸2-OH上又进行甲 基化,最后成为m7GpppNmp,这就是帽子生成。 (2)3′末端多聚A尾的生成。多聚A尾的生成是多聚A聚合酶的催化下,由ATP聚合而成。 但多聚A尾形成并不是简单地加入A,而是先要在mRNA前体的3′末端11~30核苷酸处有一段AAUAA保守序列,在U7-snRNP的协助下识别,由一种特异的核酸内切酶催化切除多余 的核苷酸。随后,在多聚A聚合酶催化下,发生聚合反应形成了3′末端多聚A尾。 (3)剪接作用。 在转录时,外显子及内含子均转录到hnRNA中。在细胞核中,hnRNA进行剪接作用,首先在核酸内切酶作用下剪切掉内含子;然后在连接酶作用下,将外显子各部分连接起来,成为 成熟的mRNA,这就是剪接作用。 一个相同的初级转录本,在不同的组织中由于剪接作用的差异可以产生具有不同编码的 mRNA,导致翻译生成不同的蛋白质产物。 在剪接作用过程中有如下一些共同的特点: 1)mRNA前体的剪切部位是在内含子末端的特定序列。内含子的序列中起始为GU;而终止于AG。 在内含子3′末端剪接点的上游20~50核苷酸范围内,还有一个在剪接中有重要作用的位 点,其序列中含有A,称为分支部位。 内含子如果其中发生部分丢失,不一定会对剪接产生影响。3′末端或分支部位发生变异,则 会导致错误的剪接。 2)套索的形成及剪除。 mRNA前体剪接过程中,先剪切下内含子,然后连接外显子。剪接的过程分两步反应进行: ①内含子序列中分支部位中腺苷酸残基(A)的2′-OH攻击内含子5′末端与外显子1连接的 磷酸二酯键,剪下了外显子1,而腺苷酸原来已有以3′、5′…磷酸二酯键相连的两个相邻的核 苷酸残基,加上此2′、5′…磷酸二酯键的连接后,形成了“套索”中间产物。②已被剪切下的 外显子1的3′末端…OH攻击内含子3,末端与外显子2之间的3′、5′磷酸二酯键,链断裂,内 含子以套索形式被剪切下来,同时外显子1与外显子2连接起来。 ③剪接体的生成。 在 mRNA前体剪接过程去除内含子时,还有多种成分的RNA…蛋白质复合体的参与,其大小为 60S,是由几种非特异的小核核糖核蛋白(UsnRNP)与mRNA前体结合而成,称为剪接体。 (UsnRNA)是一族snRNA,参与剪接作用的有多种UsnRNPs。 U1snRNP识别外显子的5′末端剪接序列,并与其互补而结合。 U5snRNP,识别并结合于 内含于3′末端剪接点。U2snRNP识别并结合于A序列的分支点。还有U4及U6snRNP也参 加到剪接体中,起配合作用。 (4)RNA编辑 在转录产物中插入、删除或取代一些核苷酸残基,生成具有正确翻译功能的模板,此即所谓 RNA的编辑作用。 编辑过程由一个或多个小分子的“指导RNA”提供mRNA的编辑信息,并作为模板指导其进行 编辑,在编辑体的帮助下进行编辑。(5)甲基化修饰 原核生物mRNA分子中不含有稀有碱基,但真核生物的mRNA中则含有甲基化核苷酸,除 了在hnRNA的5′端帽子结构中含有2-3个甲基化核苷外;在分子内部还会有l-2个m 6A 存在于非编码区。在序列中,m 6A 总是位于胞苷之后,形成了…NCm6AN序列。m 6A 的生成是在hnRNA的剪接作用之前发生的。 
(二)tRNA前体的加工 ①在核酸内切酶RNaseP作用下,从5′末端切除多余的核苷酸。 ②在核酸外切酶RNaseD作用下,从3′末端切除多余的核苷酸。 ③核苷酸转移酶催化,3′末端加CCA…OH,为tRNA加I特有反应。 ④核酸内切酶催化进行剪切反应,剪掉内含子,由连接酶连接外显子部分。 ⑤ 化学修饰作用,如甲基化、脱氨基、还原反应。 
(三)rRNA前体的加工 原核生物有 16S、23S及 5S三种 rRNA,这三种rRNA均存在于30S的rRNA前体中。转录 作用完成后,在RNaseⅢ催化下,将rRNA前体切开产生16S、25S及 5S rRNA的中间前 体。进一步在核酸酶的作用下,切去部分间隔序列,产生成熟的 16S、23S及5S rRNA, 还有成熟的 tRNA。并对16S rRNA进行甲基化修饰,生成稀有碱基。与4S rRNA加I变化 不大。 真核生物的核蛋白体中有18S、5。8S及5S rRNA。 5SrRNA自己独立成体系,在成熟过程 中加工甚少,不进行修饰和剪切。 45S rRNA前体中包含有 18S、5。8S及 28SrRNA。在 加工过程中,分子广泛地进行甲基化修饰,主要是在28S及18S中。甲基化作用多发生于核 糖上,较少在碱基上。随后45 S rRNA前体经核酸酶顺序剪切下生成18S、5。8S、28S rRNA。 
三、核酶 具有催化活性的RNA现称为“核酶”。 核酶作用方式较简单,归纳起来主要有以下几种类型:①剪切型,这类核酸能催化自身RNA 或异体RNA分子剪掉一段核苷酸片段,其催化功能相当于内切核酸酶的作用。②剪接型,这 类核酶催化自身RNA进行化学反应,首先切去自身RNA内一个核苷酸片段,再将剩余的两 个片断连接起来;相当于内切核酸酶及连接酶的联合作用。③其他类型,如核苷酸转移,脱 磷酸作用。 核酶的酶活性种类:①核苷酸转移作用。②磷酸二酯键水解作用。③磷酸转移反应催化作 用。④脱磷酸作用。⑤限制性内切酶作用。 核酶的意义:①RNA可作为生物催化剂。②打破了只有蛋白质才能有酶催化作用。③为进化 先有核酸、先有RNA提供证据。④可用于制药和临床治疗。
 四、RNA的复制 病毒RNA进入宿主细胞后,还可进行复制,即在RNA指导的RNA聚合酶催化进行RNA合成反应。 RNA复制酶催化的合成反应是以RNA为模板,由5′向3′方向进行RNA链的合成。RNA复制 酶缺乏校对功能的内切酶活性,因此RNA复制的错误率较高,RNA复制酶只是特异地对病 毒的RNA起作用,而宿主细胞的RNA一般并不进行复制。 病毒RNA复制的几种方式 (1)含正链RNA(+)的病毒(例如,噬菌体Q):(+)RNA充当mRNA,合成蛋白 (+)RNA为模板,复制,合成(…)RNA,再以(…)RNA为模板合成(+)RNA 组装成病毒颗粒。 (2)含负链RNA(…)的病毒(例如狂犬病):由(…)RNA合成(+)RNA,再由(+)RNA合成蛋 白质、(…)RNA,组装成病毒。 (3)含双链RNA的病毒(例如呼肠孤病毒):以(…)RNA为模板合成(+)RNA,以(+)RNA为 模板合成(…)RNA和蛋白,组装病毒颗粒。 (4)逆转录病毒(例如白血病毒):由RNA反转录为DNA,以DNA为模板合成RNA,翻译蛋白质。
★真核生物与原核生物蛋白质合成的异同1。mRNA 真核生物的mRNA前体在细胞核内合成,合成后需经加工,才成熟为mRNA,从细胞核输入胞浆,投入蛋白质合成;而原核生物的mRNA常在合成尚未结束时,已开始翻译。真核生 物mRNA含有7甲基三磷酸鸟苷形式的“帽”,有由多聚腺苷酸形成的“尾”,为单顺反子,只含一条多肽链的遗传信息,合成蛋白质时只有一个合成的启动点,一个合成的终点;而原核 生物的mRNA为多顺反子,含有蛋白质合成多个启动点和终止点,且不带有类似“帽”与“尾” 的结构。在5′端方向启动信号的上游存在富含嘌呤的SD区段。真核生物的mRNA则无此区 段。真核生物的mRNA代谢较慢,哺乳类动物mRNA的半衰期为4~6h,而细菌的mRNA 半衰期仅在1~3min。此外真核生物的mRNA前体常含有插入顺序,即内含子,需要在加 工时切除。 2。核蛋白体 真核生物的核蛋白体(80S)大于原核生物。小亚基为 40S含有一种 rRNA(18S rRNA); 大亚基为60S,含有 3种rRNA(28S rRNA、5。5S rRNA和 5S rRNA),所含的核蛋白体 蛋白质亦多于原核生物。原核生物小亚基16SrRNA的3′末端有一富含嘧啶的区段,可与其 mRNA启动部位富含嘌呤的SD区互补结合。在真核生物相应的rRNA(18S rRNA)中,无 此互补区。 3。tRNA 真核生物起着启动作用的氨基酸tRNA为不需要甲酰化的Met-tRNAfMet而原核生物中为 fMet…tRNAfMet,系Met-tRNAfMet经蛋氨酰tRNA转甲酰基酸催化后的产物。 4。合成过程 (1)启动。真核生物的启动因子(eIF)有9…10种,真核生物核蛋白小亚基先与Met- tRNAfMet结合,再与mRNA结合,此时需要一分子ATP。 (2)肽链延长。真核生物中催化氨基酸tRNA进入受体的延长因子只有一种(EFT1)。催 化肽酰tRNA移位的因子称为EFT2,可为白喉毒素所抑制。 (3)终止。真核生物只需一种终止因子(RF),此终止因子可识别3种终止密码子,并需 要三磷酸鸟苷。原核生物的终止因子有3种。 此外,哺乳动物类等真核生物线粒体中,存在着自DNA到RNA及各种有关因子的蛋白合成 体系,以合成线粒体的某些多肽。该体系类似原核生物蛋白合成体系。 
(四)翻译后加工 1。高级结构的修饰 肽链释放后可自行根据其一级结构的特征折叠、盘曲成高级结构。此外,高级结构的修饰还 �
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